与许多其他国家不同，日本国内并没有严格意义上官方发布的本国大学排名。这主要是因为日本大学只按地区排位，以地区上各大学的偏差值高低来决定，并没有统一排位。日本大学分为国立大学和私立大学两类，日本国立大学偏重学术研究，日本私立大学偏重社会实践，两类学校有风格差异，各有优势。
据日本文部科学省发布，日本目前拥有国立大学86所，公立大学86所，私立大学603所，计775所大学。学生数量方面，国公立大学由于学校数量较少，加上招生严格和学费低廉，所以学生数仅占全体的百分之五。
日本官方没有私立大学排名，依据国立大学排名及日本民间对大学的一个印象大致分级，结合学术排名和就业水平，反应日本人眼中大学档次。另外各院校拥有不同的优势学科，诸如东京大学法学部、一桥大学经济学部、东北大学文学部、大阪大学外国语学部。
民间排名把日本的大学共分为了S级到E级。其中，S级大学最好，是国际超一流大学。
国际超一流大学
SSS级
東京大学、京都大学、一橋大学
SS级
慶應義塾大学、早稲田大学、東京医科歯科大学、東京工業大学、国際基督教大学、上智大学、大阪大学
S级
東北大学、同志社大学、東京外国語大学、奈良県立医科大学、立教大学、名古屋大学、神戸大学、お茶の水女子大学、九州大学、自治医科大学
国际一流大学
AAA级
明治大学、日本医科大学、兵庫医科大学、北海道大学、浜松医科大学、東京慈恵会医科大学、中央大学、京都府立医科大学、青山学院大学、法政大学
AA级
岐阜薬科大学、川崎医科大学、聖マリアンナ医科大学、千葉大学、筑波大学、札幌医科大学、横浜国立大学、関西学院大学、大阪市立大学、大阪医科大学
A级
東京医科大学、国際教養大学、東京農工大学、立命館大学、横浜市立大学、学習院大学、東京理科大学、旭川医科大学、福島県立医科大学、滋賀医科大学
日本一流大学
BBB级
金沢大学、南山大学、関西医科大学、星薬科大学、津田塾大学、愛知医科大学、日本女子大学、関西大学、広島大学、神戸市外国語大学
BB级
昭和大学、名古屋市立大学、東京女子医科大学、和歌山県立医科大学、大阪府立大学、帯広畜産大学、豊田工業大学、武蔵大学、京都府立大学、東京女子大学
B级
順天堂大学、岡山大学、京都女子大学、金沢医科大学、岐阜大学、京都工芸繊維大学、京都薬科大学、東京歯科大学、聖路加国際大学、産業医科大学
日本次一流大学
CCC级
名古屋工業大学、明治学院大学、成蹊大学、熊本大学、國學院大学、首都大学東京、三重大学、獨協医科大学、長崎大学、関西外国語大学
CC级
新潟大学、立命館アジア太平洋大学、徳島大学、北里大学、藤田医科大学、成城大学、明治薬科大学、奈良女子大学、獨協大学、東邦大学
C级
名古屋外国語大学、大阪薬科大学、昭和薬科大学、日本赤十字看護大学、名古屋学芸大学、同志社女子大学、富山大学、中京大学、東京海洋大学、東京薬科大学
国内二流大学
DDD级
電気通信大学、日本獣医生命科学大学、学習院女子大学、東京学芸大学、昭和女子大学、都留文科大学、東京家政大学、女子栄養大学、芝浦工業大学、東京農業大学
DD级
信州大学、滋賀大学、静岡県立大学、専修大学、西南学院大学、東北医科薬科大学、埼玉大学、聖心女子大学、愛知県立大学、福井大学
D级
近畿大学、愛知大学、鳥取大学、福岡女子大学、駒澤大学、武庫川女子大学、鹿児島大学、香川大学、日本大学、武蔵野大学
EEE级
東洋大学、神奈川県立保健福祉大学、龍谷大学、静岡大学、愛媛大学、岩手大学、山口大学、群馬県立女子大学、高崎経済大学、神戸市看護大学
EE级
杏林大学、神田外語大学、甲南大学、神戸薬科大学、皇學館大学、九州歯科大学、愛知淑徳大学、福岡大学、二松學舍大学、名城大学
E级
群馬大学、長野大学、九州工業大学、宮崎大学、ノートルダム清心女子大学、国際医療福祉大学、佐賀大学、山形大学、京都市立芸術大学、茨城県立医療大学
国内三流大学
近500所各式各样私立大学
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