阿姆斯特丹大学（荷文：Universiteit van Amsterdam；英文：University of Amsterdam，简称UvA）创建于1632年，是一所坐落在荷兰首都阿姆斯特丹的研究型大学。学校共诞生了六位诺贝尔奖获得者，五位荷兰首相，七位斯宾诺莎奖得主和一位图灵奖得主。在2024QS世界大学排名中位列世界第53位，在2022年U.S. News世界大学排名中位列世界第38位。
研究方向：微生物组生物信息学
项目介绍：
您是否对微生物组及其与人类宿主的相互作用感兴趣？微生物组研究在过去十年中蓬勃发展，这在很大程度上要归功于可以相对轻松地生成大量宏基因组测序数据。生物信息学方法的发展已经取得了进展，但到目前为止，人类微生物组的研究主要是“谁在那里”，其次是微生物代谢指标和一些特定的分子类别，如抗生素耐药性。长期的生物医学知识表明，微生物之间，尤其是与宿主之间的相互作用的重要部分是由结构相互作用决定的，但这几乎被忽视了。最先进的生物信息学方法可以应对这一挑战！您想和课题组一起解决这个疏忽吗？
在这个博士项目中，目标是开发和扩展生物信息学方法，以便挖掘宏基因组测序数据集中与人类细胞（特别是免疫系统）的物理相互作用相关的特征。为此，您将利用经典的生物信息学和机器学习方法来检测序列和蛋白质结构数据中感兴趣的特征。将新方法应用于宏基因组学数据后，您还将测试哪些类型的统计考虑因素对于解释结果很重要。
该课题小组在生物信息学、多元统计和建模方面经验丰富，并越来越关注微生物组研究，例如在 UvA 的研究重点领域个性化微生物组健康和系统生物学宿主-微生物组相互作用和荷兰全微生物组计划中开展了活跃的合作。你要做什么？您将接受以下方面的培训并有望做到：
1. 在四年的正式任职期限内完成博士论文；
2. 设计、应用和基准测试生物信息学算法、工具和工作流程，以预测基于人类微生物组的宏基因组学测序数据的宿主-微生物组相互作用；
3. 使用您的和现有的方法来分析现有和新的宏基因组学数据集；
4. 以一种易于理解、开放的科学方式记录您的工作；
5. 在同行评审的手稿中以及作为博士论文的一部分发表研究结果；
6. 参加博士研究生培养计划；
7. 成为生物系统数据分析小组的活跃成员。
申请要求：
1. 生物信息学硕士学位；或数据科学、信息学或具有较强生物学或生物医学成分的相关学科学位；
2. 或具有较强信息学成分的生命科学或生物医学科学领域；
3. 具有组学数据分析和编码技能的实践经验——具有微生物组数据和机器学习经验者优先；
4. 具有流利的英语书写和口语能力，并有信心在科学交流和出版中使用英语；
5. 对多元化团队中微生物组研究中的人类生物信息学的热情，以及承担责任的能力。
申请材料：
一封求职信，以及您的简历；
两位学术推荐人的联系方式。
申请截止时间：2024年9月29日
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