10月23-26日，西交利物浦大学学生团队在法国巴黎举行的2024国际基因工程机器大赛（iGEM）中摘得一金一铜。今年的iGEM大赛吸引了全球400余支团队、5000余人现场参与。西浦获得金奖和铜奖的学生团队分别为XJTLU-Software和XJTLU-CHINA。据悉，自2015年以来，西浦学生团队在历年iGEM大赛中共摘得六金三银一铜。
iGEM由美国麻省理工学院于2003年创办，现已发展成为全球合成生物学领域最具影响力的国际性学术竞赛。作为顶级的跨学科大学生赛事，它融合了生命科学、化学、数学、信息科学、工程学、计算机科学等多领域知识，吸引了包括哈佛大学、麻省理工学院、斯坦福大学、清华大学、北京大学在内的全球顶尖学府参与。
XJTLU-Software团队是在西浦慧湖药学院的支持下于2024年1月通过学生自主组队而新成立的团队，共由来自西浦慧湖药学院、理学院和数理学院的6位本科生组成，创队目标是致力于解决合成生物学中涉及到的计算建模、模拟仿真和数据分析等问题，为合成生物学和iGEM社区提供全新的计算解决方案。
XJTLU-Software团队成员由来自应用统计学、应用数学和生物信息学专业的同学组成，在西浦指导老师的支持下，一边进行大语言模型（LLM）和检索增强生成RAG系统等大量的自主学习，同时也在不断地挖掘AI医疗、生物部件库、工程化设计等值得投入的现实问题。最终根据实际需求并结合资源情况，XJTLU-Software将参赛项目定为“ChatParts”，即利用大语言模型优化iGEM parts数据库和创建整合了AI助手的线上论坛。
确定参赛主题后，面对iGEM历年赛事累积的庞大的生物部件数据库，XJTLU-Software团队制定了开发方案，即“收集必需数据→构建RAG系统和数据库→训练问答大语言模型→软件实现”。使用爬虫收集信息和脚本自动回答格式化问题，通过多周期的高质量数据收集评估、RAG系统与本地微调预训练模型的结合，XJTLU-Software最终完成了一个可回答合成生物学相关问题的“ChatParts”本地AI助手。这个软件源代码、数据、模型权重等已分享至Github、Hugging Face等平台，可进行进一步的开发和优化。
为了促进西浦师生在合成生物学领域的国内国际学术交流，西浦慧湖药学院不仅支持学生们组队参与iGEM大赛，今年还支持这两支iGEM学生团队一起承办了iGEM第十一届中国地区交流会（Conference of China iGEMer Community，CCiC）。近千人出席会议，来自清华大学、北京大学、浙江大学、上海交通大学、复旦大学等高校的89支代表队与来自中国人民大学附属中学等高中的35支代表队，分享和展示iGEM参赛项目，与学术界和产业界的专家深入交流，激发创新火花。
CCiC大会目前已成为全国最具规模的大学生学术会议之一，2024年度以“SynBio Nexus”合成生物·联结为主题。为期三天的会议中，全国124支iGEM代表队在西交利物浦大学会场分别围绕生物制造、气候危机、肿瘤学、食品、农业、太空等议题做项目分享，踊跃探讨合成生物学作为交叉学科的中心节点，如何在基础科学研究与实际应用之间建立桥梁。
对于本科生同学来说，iGEM是一个能全面提升自主能力、创新想法和基础学术的比赛，历经实验、建模、调研、网页呈现研究、成果答辩等长达九个月的项目过程，不同年级、不同专业的同学们通过相互学习、交流和碰撞，从中都可以得到相应的成长。此外，CCiC大会是参赛者们了解同行新奇想法和比赛进度的良机，也是和其他上百支团队一起构建社区、推进领域交流的重要契机。
扬子晚报/紫牛新闻记者 顾秋萍 通讯员 寇博
校对 李海慧
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