韩国亚洲大学医学院Su Bin Lim团队强调单细胞和空间转录组学在探索下丘脑细胞类型分子遗传多样性方面的应用价值
阐明下丘脑中复杂的动态细胞组织对于理解其在协调基本身体功能中的作用至关重要。在过去的十年中，单细胞和空间组学技术取得了显著发展，克服了捕获和分析单个细胞的最初技术挑战。这些高通量组学技术现在提供了一个绝佳的机会来理解整个下丘脑转录多样性和细胞类型特征的复杂时空模式。目前的单细胞和单核 RNA 测序方法通过探索下丘脑各个亚区域的不同表型来全面量化基因表达。然而，单细胞/单核转录组测序技术需要将细胞/细胞核与组织分离，可能导致有关神经元网络的空间信息丢失。空间转录组学方法绕过细胞解离，可以通过成像和测序技术阐明神经网络复杂的空间组织。
来自韩国亚洲大学医学院Su Bin Lim团队认为，多组学研究的目标，特别是在单细胞和空间分辨率的设置中，是开发捕捉瞬时表型和祖先细胞状态的方法。这需要在活细胞研究中使用多组学技术，并改进计算方法，从每个分子层提取更精确的数据。跨学科的研究合作对于识别数据之间和数据内部的相关性至关重要。解决这些挑战将需要高质量的单细胞空间组学技术，如长读单分子测序读出技术，以及组合分析的创新。开源单细胞空间组学分析方法的日益普及将促进更广泛的研究应用，这一趋势已经在进行中。总之，尽管神经科学取得了重大进展，但仍在努力加深对神经细胞复杂性和功能的理解。现在是时候将传统的生物策略与复杂的网络方法结合起来，以获得潜在的变革性结果。当前的挑战在于整合来自这些生物来源的组学数据，以全面了解脑细胞基础及其对神经行为和疾病的影响。
文章在《中国神经再生研究（英文）》杂志2025年 6月 6 期发表。
文章来源：Junaid M, Lee EJ, Lim SB (2025) Single-cell and spatial omics: exploring hypothalamic heterogeneity. Neural Regen Res 20(6):1525-1540. doi.org/10.4103/NRR.NRR-D-24-00231
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